空間プロテオミクスで腫瘍の異質性を解明する
GeoMx Immuno-Oncology Protein Panelsのモジュラー設計により、異なる組織区画や細胞種集団から、免疫腫瘍学研究に関連する最大96種類のヒトまたはマウスのタンパク質をプロファイリングできます。nCounter®解析システムによるターゲット指向のコンテンツと迅速な読み出しを活用し、バイオマーカーの発見と検証のための大規模コホート研究に簡単にスケールアップできます。特殊な組織マウンティングが必要なく、標準的な組織染色と互換性のあるワークフローで、研究室の能力に空間プロテオミクスを容易に追加できます。
Immune Cell Profiling Coreには、広範な細胞プロファイリング向けに18のターゲットが含まれており、すべてのGeoMx DSP実験に必要なコントロールも含まれています。最大6つのモジュールに加えて、カスタムターゲットを5〜10個追加して、実験用のコンテンツを調整できます。すべてのコアとモジュールには、独自のオリゴヌクレオチドバーコードで標識された検証済みの抗体が含まれています。形態学的に関心のある領域（ROI）を選択しUV照射でこのバーコードの結合が切断されて、各バーコードは特有の蛍光バーコードを含む一意のリポータープローブによって認識されます。リポータープローブはnCounter®解析システムによって撮影され、数えられ、それぞれの対応するROIにマッピングされたタンパク質発現をデジタルなカウントとして読み出します。
ROI (関心領域)は、非小細胞肺癌 (NSCLC) のFFPE組織で、混合腫瘍と腫瘍微小環境（免疫）セグメントで選択されました。 それはPanCK / CD45形態染色に基づいてセグメンテーションされました。タンパク質発現はコンパートメントによって強力なクラスタリングを示しています。
免疫腫瘍学向けに慎重に選定されたコンテンツ
アッセイの検証
すべてのGeoMx Protein Assaysは、高品質なGeoMx DSPデータを確保するために徹底的な検証を受けます。
各抗体は、オリゴヌクレオチド結合前後において特異性をテストし、アッセイ内での性能を確認します（Figure 1）。また、各モジュールの性能も検証され、単体での性能と他のモジュールとの組み合わせにおける性能が確認されます（Figure 2）。
Figure 1: 例として、PD-L1（DPROT_00004.1）は特定のインデックス付きオリゴヌクレオチドに対する共役化前後の特異染色をテストし、共役化が特異性に影響を与えないことを確認します。
Figure 2: 免疫細胞プロファイリングコアの信号を例示し、個々のモジュールを含めた免疫細胞プロファイリングコアと比較して、MOLT4細胞株における抗体間干渉がないことを確認します。また、組み合わせたコアとモジュールのテスト前に単一抗体の干渉テストも実施されます。
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